Kristian Lien öppnade målskyttet i den 35:e minuten. Jeppe Okkels utökade till 2-0 i den 58:e. Patric Åslund satte 3-0 i den 82:a minuten.
Malmö hade några sekvenser under den första halvtimmen. Sedan föll allt samman.
– Vi var inte ett lag sista timmen. Vi öppnade upp oss, vi var långa, breda och blottade oss för kontringar, säger Gaute Helstrup efter matchen.
Thern är brutal i sin analys i Fotbollskanalen. Bara två MFF-spelare skulle ta plats i Djurgårdens startelva enligt experten.
– Är väl möjligen Sead Haksabanovic och Busanello som hade platsat i dagens Djurgården, säger Thern.
Helstrup har nu fyra segrar, tre förluster och ett kryss. Fem av matcherna mot lag i bottenstrid.
Malmö har spenderat cirka 250 miljoner på värvningar. Knappt något av dem kan klassas som en riktigt bra värvning enligt Thern.
Sportchef Philip Berglund har påbörjat en rensning av truppen.