Utmärkelsen gäller klubbens zonutvecklingsarbete. Häcken samarbetar med sexton föreningar i regionen.
Runt 3 000 unga spelare får tillgång till tränar-, spelar- och klubbutveckling.
– Det behövs många miljöer där unga människor har möjlighet att drömma stort, säger Anders Wahrnberg, akademichef i BK Häcken.
Klubbchef Marcus Jodin kallar priset "stort".
– Att vinna ett så fint pris som UEFA Grassroots Awards är något vi är väldigt stolta över, säger Jodin.
Utmärkelsen visar att Häckens arbete med breddklubbar nu fått internationell uppmärksamhet.