Lottningen genomfördes i Monaco på fredagen. Mjällby fick sitt motstånd efter förlusten mot Red Bull Salzburg i Europa League-playoffet.
Atalanta från Italien är den tuffaste utmaningen. Matchen spelas på bortaplan.
Tre matcher kommer att spelas hemma i Strandvallen. Pafos från Cypern, FK Borac från Bosnien och Hercegovina samt Inter Escaldes från Andorra.
De tre bortamatcherna går mot Atalanta, Kairat Almaty från Kazakstan och Iberia Tbilisi från Georgien.
Ligafasen startar den 15 oktober. Sista matchen spelas den 17 december.
Det är allsvenska mästarnas första säsong i Europa någonsin.