Abdoulaye Doumbia och Gustav Lindgren gjorde målen för hemmalaget.
Första halvlek var intensiv och tempofylld. Lagen gick till paus 0–0.
– Vår första halvlek är svag, framförallt i presspelet där vi blir för passiva, säger Jens Gustafsson.
Alla tre mål kom i andra halvlek. Häcken kom ut med ny energi efter pausvilan.
– Vi vinner andrabollarna och är mer intensiva, säger Gustafsson som lyfter fram inhopparnas insats.
Hemmalaget tog sin andra derbyseger i rad efter förra veckans vinst borta mot IFK Göteborg.
Häcken fortsätter sin positiva trend i de göteborgska derbyna.