Sebastian Larsson satte 1-0 på straff i den 25:e minuten. Oscar Ottosson avgjorde i den 94:e minuten.
Degerfors hade fyra avslut på mål mot Göteborgs sju. Bollinnehavet var jämnt, 49 mot 51 procent.
Yiriyon Gideon och Bilal Hussein fick varningar för Degerfors. Elias Barsoum, Robin Dzabic och Ludvig Fritzson startade i anfallet men kunde inte hitta nätet.
Matchen var jämn sett till statistiken. Men Göteborg utnyttjade sina chanser bättre.
Degerfors saknade flera spelare till skada, däribland Juhani Pikkarainen, Daniel Sundgren och Erik Lindell.
Förlustsviten innebär att Degerfors nu har halkat ner på nedflyttningsplats i tabellen.