Mikael Anderson nickade in 1-0 för hemmalaget efter en kvart. Det var hans första allsvenska start för säsongen.
– Det var en bra start för mig och bra för självförtroendet, säger Anderson till TV4 i paus.
Men Sirius vände matchen innan halvtid. Marcus Lindberg kvitterade och sedan gav Isak Bjerkebo och Robbie Ure Sirius ledningen till 2-1.
Neo Jönsson avgjorde med 3-2 efter ett inlägg från Ure. 19-åringen firade framför Djurgårdens klack och fick gult kort.
– Jag ser svart. Jag vet inte ens vad som händer vid målet. Men jag gör mål och då firar jag, säger Jönsson till UNT.
Djurgårdens tränare Jani Honkavaara var självkritisk efter förlusten.
– Tyvärr var Sirius det bättre laget i dag, säger Honkavaara enligt FotbollSthlm.
Sirius har inte förlorat en allsvensk match sedan 8-2-förlusten mot Djurgården förra säsongen.