Lottningen genomfördes i Monaco på fredagen. Tre hemmamatcher och tre bortamatcher väntar i ligafasen.
Mjällby fick sluta drömmen om Europa League efter förlusten mot RB Salzburg i playoffet. Nu väntar Conference League istället.
Atalanta från Italien blir tyngsta motståndet. Matchen spelas borta.
Hemmamatcherna spelas mot Pafos från Cypern, FK Borac från Bosnien och Hercegovina samt Inter Escaldes från Andorra.
Borta väntar utöver Atalanta också Kairat Almaty från Kazakstan och Iberia Tbilisi från Georgien.
Ligafasen inleds den 15 oktober.
Det är första gången Mjällby spelar europeisk fotboll. Nu får de chansen att fortsätta äventyret i Conference League.