Simon Kjaer öppnade målskyttet efter fyra minuter. Tom Pettersson utökade till 0-2 i den 30:e minuten. Yasin Manneh satte sedan 0-3 i den 37:e minuten.
Degerfors fick reducera genom Nasiru Moro i den 51:a minuten. Men Viktor Gustavsson avgjorde med 1-4 i den 84:e minuten.
Mjällby dominerade matchen med 57 procent bollinnehav. Nio avslut mot Degerfors åtta. Sex skott på mål mot hemmalagen tvåa.
Kazper Karlsson fick gult kort för Degerfors. Tom Pettersson och Viktor Gustavsson varandes för Mjällby.
Degerfors fortsätter att kämpa i botten av Allsvenskan medan regerande mästarna Mjällby visar att de är med i toppen även denna säsong.