Skinner har lett United sedan 2021. Under hans tid vid klubben har laget tagit sig till Champions League och vunnit FA-cupen.
– Marc lämnar efter att ha spelat en betydande roll i utvecklingen av Manchester Uniteds damlag, skriver klubben.
Beskedet berör flera svenska landslagsstjärnor. I Manchester United spelar Fridolina Rolfö, Ellen Wangerheim, Julia Zigiotti Olme, Anna Sandberg och Hanna Lundkvist.
För det svenska landslaget är nyheten betydelsefull. Flera av de svenska spelarna i truppen har alltså nu en ny situation inför säsongen i Women's Super League.
Skinner tog över United 2021 och byggde upp laget under flera år. Champions League-spelet och FA-cuptiteln räknas som hans största meriter med klubben. Nu lämnar han och United söker en efterträdare.
Klubben har ännu inte meddelat vem som tar över tränaransvaret.