Blåvitt ligger på plats 13 i allsvenskan. Bara tre poäng skiljer till negativ kvalplats.
– Föreningen bedömer att skiftet är nödvändigt för att skapa förutsättningar för en omstart, säger fotbollschef Jesper Jansson.
Billborn kom till klubben för två år sedan i ett svårt läge. Han säkrade allsvenskt kontrakt och tog laget till en fjärdeplats förra säsongen.
Nu är det slut.
Björklund har varit assisterande tränare sedan sommaren 2024. Han ska enligt klubben "bryta mönster och tillföra nya idéer".
– Jag tar mig an uppdraget med ödmjukhet men också med en stark tro på att vi kan vända det här, säger Björklund.
– Joachim står för ett tydligt ledarskap och bidrar med hög energi, säger Jansson.
IFK Göteborg gör sin andra tränarväxling på två år i kampen för att undvika nedflyttning.