Enligt Göteborgs-Posten ska avgången ha föregåtts av att Fernandez försökte byta ut den tekniske direktören Magnus Sköldmark. 66-åringen har haft sportsligt ansvar i styrelsen.
Holmberg är tydlig med att han värdesätter Fernandez högt.
– Jag uppskattar Lallo enormt. Han kommer vara saknad, men jag tror han fattar sina beslut utifrån vad som är bäst för klubben, säger Holmberg till GP.
Skiljemeningen ska ha handlat om klubbens tillväxttakt och investeringsnivå. Trots turbulensen väljer Holmberg att lyfta fram Fernandez karaktär.
– Han satte Gais först, före sig själv. Han kommer vara saknad, men jag har väldig tilltro till vår styrelse och vår sportsliga ledning. Vi har vår väg och vår plan framåt. I det hela känns det väldigt lovande inför framtiden för Gais, säger han till GP.
Holmberg understryker att spelartruppen och tränarstaben hållits utanför händelseförloppet.
– De har hållit det här helt borta från oss. Jag är inte inne i detaljfrågorna och har inte försökt komma in där nu efteråt heller, säger han.
Tränarens budskap är tydligt: det är dags att gå vidare.
– Jag konstaterar bara att så här är det. Den informationen jag har fått har jag fått. Det är tillräckligt för att kunna vända blad och ta det här vidare. Det kommer bli bra för Gais, avslutar Holmberg.
Sköldmark själv vill inte kommentera situationen.