Paulos Abraham spräckte nollan i den åttonde minuten efter inspel från Viktor Lind. Mads Hansen kvitterade för BP framför mål.
Strax innan paus hittade Montader Madjed fram till Markus Karlsson som gav Hammarby ledningen igen. Det var Karlssons första mål för säsongen.
Tio minuter efter paus ökade Hammarby till 3-1. Lind slog in en frispark som avgjorde matchen.
Oscar Steinke gjorde sin första start för Hammarby. 20-åringen fick förtroendet från start av tränaren.
BP-debuten för tidigare Hammarby-backen Pavle Vagic slutade i förlust.
Hammarby hade minskat avståndet till Sirius till sex poäng innan de senaste två matcherna. Efter poängtappen växte glappet till åtta poäng. Segern får Bajen tillbaka i guldstriden.