Stratos Svarnas nickade in matchens enda mål på tilläggstid i första halvlek. Det kom efter en frispark som Amin Boudri orsakade.
Halvminuten innan ville Boudri ha straff i offensivt straffområde. Domaren Luca Pairetto viftade avvärjande.
– Det är solklar straff. Jag vet inte vad han snackar om, sa Boudri i halvtid till Aftonbladet.
Värre skulle det bli. I den 54:e minuten drog Boudri på sig sitt andra gula kort och blev utvisad.
– Det blir så ibland när man är för het, när man vill för mycket. Den här gången blev det fel, sa Boudri efteråt.
Trots underläge i numerär hade Hammarby flera kvitteringslägen. Men lämnade matchen mållöst.
– Vi fick exakt vad vi förtjänar. Vi kan inte tycka synd om oss själva, sa Henrik Rydström efteråt till Fotbollskanalen.
Allsvenskans dyraste spelare någonsin blev i stället matchens stora syndabock när Hammarbys Europadröm dog på hemmaplan inför 19 719 åskådare.