Abdoulaye Doumbia och Gustav Lindgren gjorde målen för hemmalaget.
Första halvlek var jämn och intensiv. Lagen gick till paus med 0–0.
– Vår första halvlek är svag, framförallt i presspelet där vi blir för passiva, säger tränare Jens Gustafsson.
Alla tre mål kom efter paus. Häcken kom ut med helt annan energi i andra halvlek.
– Vi vinner andrabollarna och är mer intensiva upp, säger Gustafsson som lyfter fram inhopparnas insats.
Adrian Svanbäck pratade före matchen om vikten av hemmastödet.
– Att få känna läktarstödet kan bli avgörande, sa Svanbäck.
Det blev Häckens andra raka derbyseger efter vinsten mot IFK Göteborg förra helgen. Självförtroendet växer i gult och svart.