Gabriel Busanello och Erik Botheim gav Malmö 2–0-ledning i första halvlek. Men Häcken kom tillbaka.
Lindgren reducerade i den fjärde minuten. Ett självmål gjorde det 2–1 i den 20:e. Lindgren kvitterade i den 37:e och avgjorde kort efter.
6 163 åskådare såg Häcken ta sin tredje segern för säsongen. Laget är fortsatt obesegrat efter sju omgångar.
Malmö-tränaren Miguel Angel Ramirez var kritisk efter matchen:
– Det var för lätt att göra mål på oss idag. Vi måste försvara bättre, vi måste vara mer aggressiva över hela banan.
Häcken-kaptenen Mikkel Rygaard hade sagt före matchen att laget behövde bli mer noggranna i straffområdena. Det blev Malmö som inte höll tätt.
Häcken har nu tio poäng och fortsätter klättra i tabellen.