William Milovanovic skulle rensa bollen i eget straffområde. Malte Persson kom emellan och sparkades ner.
Rocco Ascone höll nerverna i styr och satte straffen säkert. Halmstads BK räddade en poäng på Gamla Ullevi.
Första halvlek slutade mållös. I den 52:a minuten hittade Robert Frosti Thorkelsson fram till Henry Sletsjöe.
Sletsjöe bredsidade in 1–0 bakom Tim Rönning.
Gais dominerade efter målet och hade bud på fler fullträffar. Men i stället blev det straff.
– Det är inget att snacka om, sade TV4:s kommentator Niklas Jarelind.
Sletsjöe var besviken efteråt:
– Jag tycker att det är flera gånger under säsongen vi spelat för dåligt i slutet av matcherna. Vi blir fega och oorganiserade. Vi har bara oss själva att skylla.
Halmstads tränare Stuart Baxter hade blandade känslor. Han vittnade om att laget släppt in många mål i början av andra halvlekar under säsongen.
– Jag trodde jag skulle svimma av när vi gjorde det igen. Men jag är nöjd med hur vi svarar upp på det, sade Baxter.
Poängen var viktig för Halmstads BK i bottenstriden. Det var lagets blott sjunde poäng för säsongen. Nu är det tre pinnar upp till Degerfors på kvalplats — och ytterligare tre upp till IFK Göteborg på säker mark.
Gais huserar i mitten av tabellen. För dem blev det en besk avslutning på en vecka som inleddes med Europaseger mot Nordsjælland.