Sebastian Larsson satte 1-0 på straff i den 25:e minuten. Jesper Ottosson avgjorde i den 94:e minuten.
Degerfors hade 49 procent bollinnehav och sju avslut. Fyra på mål.
Det räckte inte. Göteborg var effektivare med tio avslut och sju på mål.
Yiriyon Gideon och Bilal Hussein fick varningar för Degerfors. Ahmad Faqa och Samba Diatara byttes ut i slutskedet.
Degerfors saknade flera spelare. Juhani Pikkarainen, Daniel Sundgren, Erik Lindell, Sebastian Ohlsson och Ziyad Salifu var alla borta.
Femte raka förlusten sätter press på Degerfors i botten av tabellen.