Arben Zeneli gav Elfsborg ledningen redan i den femte minuten. Jens Stryger kvitterade för Malmö i den 22:a.
Sedan kom Momoh Ibrahim Kamara. Han gav Elfsborg segern i den 34:e minuten.
Malmö hade periodsvis spelövertag. Men kunde inte utnyttja det.
– Prestationsmässigt hade jag hoppats på mer, säger Gaute Helstrup efter matchen.
Han är inte nöjd med lagets hantering av Elfsborgs kontringar. Inte heller med presspelet.
– Vi hanterade inte Elfsborgs kontringsspel så bra som vi borde ha gjort, säger Helstrup.
Malmö fick ett rött kort under matchens gång. Efter utvisningen blev laget bättre, enligt tränaren.
– Det är intressant att se att vi är som bäst efter det röda kortet, säger Helstrup.
Förlusten innebär att Malmö tappar mark i toppen av tabellen.