Leo Östman gav Elfsborg ledningen redan i den sjunde minuten. Hans tredje mål på tre matcher.
Elfsborg dominerade första halvleken. Men bara 1-0 i paus. Det straffade sig.
I början av andra halvleken kombinerade sig Mjällby fram. Jeppe Kjaer avslutade distinkt och kvitterade.
Djupt in på tilläggstid hade Elfsborg chansen att avgöra. Målvakten Robin Wallinder räddade Frederik Ihlers avslut ut till hörna.
Mjällby kom till Borås med en brutal frånvarolista. Axel Norén, Timo Stavitski, Elliot Stroud, Tom Pettersson, Max Nielsen, Viktor Gustafson och Abdoulie Manneh saknades alla.
På uppvärmningen tvingades även Abdullah Iqbal kasta in handduken efter en ryggkänning.
– Vi förlorade sju spelare på sju dagar – det måste vara världsrekord på så kort tid, säger tränaren Karl Marius Aksum till Expressen.
Villiam Granath spelade trots att han spydde kvällen innan och hade hög feber.
Elfsborg missade chansen att gå upp på andra plats efter Hammarbys förlust i går.