Redan under sommaren 2025 stod det klart att 53-åringen skulle lämna klubben. Det skapade en svår situation när Malmös säsong sedan urartade.
– Under hösten tyckte jag att det var riktigt jobbigt att vi inte kunde leverera på en annan nivå än vad vi gjorde. Men samtidigt är det så fotbollen är, säger han i podcasten Lundh på Fotbollskanalen.
Trots det tunga slutet behöll han tron på organisationen. Han är övertygad om att klubben hittar rätt igen.
– Det vi vet är att det finns en organisation i Malmö som är så stark att jag inte är orolig för att man inte kommer att komma rätt igen. Sedan kanske man inte gör det direkt, men man kommer att komma rätt, säger han i podcasten.
Han är dock ärlig med att avslutningen inte var den han hade hoppats på.
– Man vill alltid kunna lämna när man är hyfsat på topp. När jag tog beslutet var vi någon helt annanstans än var det slutade sedan, säger Carlnén.
Efter avgången fick han snabbt ett nytt uppdrag. Han tillträde som generalsekreterare på Svenska Fotbollsförbundet.
Malmö FF slutade på sjätteplatsen i Allsvenskan förra säsongen. Klubben redovisade också rekordförluster ekonomiskt. Men säsongen 2026 har börjat bättre. Laget har vunnit två av sina inledande matcher och tagit ett kryss.