Andreas Brännström fick bara en timmes träning med laget innan hans comeback som tränare. Det räckte till en poäng.
Jacob Bergström nickade in 0–1 i den 17:e minuten. Mjällby ledde i 45 minuter.
Julius Lindberg kvitterade efter paus för hemmalaget. Sedan tog matchen slut.
– Jag har väl aldrig haft så lite underlag för att ta ut ett lag, säger Brännström till SVT Sport.
Robin Wallinder var tillbaka i målet efter att ha petats i tidigare matcher. Axel Norén och Viktor Gustafson fick också starta.
Brännström sparkades i AIK och var tillbaka i Mjällby bara några dagar senare. I tisdags fick Karl Marius Aksum sparken.
– Lite av en berg-och-dalbana har det väl varit, säger Brännström.
Häcken ligger på fjärdeplats, Mjällby på tolfte – krysset håller dem båda kvar i sina positioner.