Dino Besirovic tvingades kliva av med en vaddskada i samband med straffmålet. Han ska genomgå MR-undersökning.
– Jag passade bollen till Celina och då kände jag att någonting var fel. Det var väldigt smärtsamt, säger en nedstämd Besirovic.
Bersant Celina fixade straffen när han fälldes av KFF-målvakten Jakob Kindberg. Förarbetet kom från talangen Zadok Yohanna.
Johan Hove satte straffen säkert i den 26:e minuten.
Kalmar hade en pigg inledning. Marius Söderbäck fick två fina chanser men Kristoffer Nordfeldt räddade.
– Vi kanske underskattade dem, säger Hove efter matchen.
– Jag tyckte de gjorde flera bra saker och gjorde det svårt för oss.
AIK har nu sju poäng på tre matcher. Kalmar står fortfarande på noll.
19-årige Stanley Wilson har spelat 260 av 270 möjliga minuter denna säsong för AIK.