Turneringen spelas mellan 26 och 30 maj. Men 19-åringen blir kvar i Stockholm.
Beslutet grundar sig på att Yohanna befinner sig i rehabilitering. Dessutom anser AIK att han är en viktig spelare för klubben.
Yohanna missade senast bortamötet mot Västerås SK på grund av skada. Han hade även missat allsvenska matchen mot Sirius om han rest till London.
Turneringsdagarna är inte officiella Fifa-dagar. Därför ligger beslutet helt i AIK:s händer.
Klubben skriver samtidigt att de hoppas få se Yohanna representera Nigeria längre fram.
Det är ett bakslag för den nigerianska landslagsledningen som presenterade truppen med Yohanna under onsdagen.